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Que signifie « composition de type cellulaire » ?

Que signifie « composition de type cellulaire » ?


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Je lis un article sur la détection de la méthylation différentielle. Ils utilisent le terme « composition de type cellulaire » dans le contexte suivant :

« Les chercheurs doivent concevoir avec soin des études qui associent les phénotypes à la méthylation de l'ADN. Certains aspects, tels que la composition du type cellulaire, ne peuvent pas être facilement contrôlés par la conception ; les patients et donc les échantillons d'ADN individuels diffèrent simplement par leur composition de type cellulaire. » (Robinson, M.D., 2014)

J'aimerais savoir à quoi se réfère la « composition de type cellulaire » ?

Fait-il référence à la composition d'un type cellulaire spécifique en termes de schéma de méthylation (ou peut-il se référer à quelque chose de plus général en dehors de ce contexte) ? Il est logique pour moi que différents types de cellules aient des schémas de méthylation différents, c'est pourquoi il existe différents types de cellules en premier lieu. Mais est-ce que même au sein d'un type cellulaire spécifique, la composition du schéma de méthylation est différente d'un individu à l'autre ?


Le problème est que pour la plupart des opérations de séquençage, vous avez encore aujourd'hui besoin de plus d'une cellule - même si cela changera bientôt.

En conséquence, vous devez échantillonner des cellules d'un tissu qui contient souvent, sinon généralement, plus d'un type de cellule, voir par ex. cette image d'un tissu pulmonaire de l'article de Wikipédia sur les tissus liés ci-dessus :



Il n'est pas toujours facile de prélever des cellules d'un seul type (pensez à l'essayer avec du sang, qui est aussi un tissu). Donc ce que vous obtenez alors est un mélange de différents types de cellules qui diffèrent probablement dans les modèles de méthylation.

Fait-il référence à la composition d'un type cellulaire spécifique en termes de schéma de méthylation (ou peut-il se référer à quelque chose de plus général en dehors de ce contexte) ?

Non, cela signifie que vous avez des cellules de différents types dans votre échantillon.

Il est logique pour moi que différents types de cellules aient des schémas de méthylation différents, c'est pourquoi il existe différents types de cellules en premier lieu.

Au moins une des raisons, il y en a plus, par ex. d'autres modifications et mutations.

Mais est-ce que même au sein d'un type cellulaire spécifique, la composition du schéma de méthylation est différente d'un individu à l'autre ?

C'est un problème différent et c'est peut-être vrai aussi. Mais ce n'est pas ce à quoi votre citation, si je comprends bien, fait référence. Ils font référence au problème selon lequel vous pouvez échantillonner le même tissu chez des patients tout en obtenant un résultat différent. composition de cellules de différents types en raison d'une erreur d'échantillonnage.


Voir la vidéo: Biologie Cellulaire: Introduction générale sur la composition de la cellule (Décembre 2022).